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期刊論文
1. 鄭政誠，1991，〈再論文景之治〉，《史苑》，第52期，頁75-79。2. 鄭政誠，1993，〈評介馮爾康等著《清人社會生活》〉，《師大歷史學報》，第21期，頁221-228。
3. 鄭政誠，1997，〈高中歷史教材編寫之外緣性探討〉，《高中歷史教學與研究》，第3期，頁238-241。
4. 鄭政誠，1997，〈同治年間台灣與英國樟腦貿易之研究〉，《建中學報》，第3期，頁215-228。
5. 鄭政誠，1997，〈評介中村孝志編《日本の南方關與と台灣》〉，《歷史教育》，第2期，頁229-248。
6. 鄭政誠，1998，〈連橫《台灣通史》內有關「列傳」體例之探討〉，《輔大歷史學報》，第9期，頁165-178。
7. 鄭政誠，1998，〈清代三重埔的拓墾〉，《史耘》，第3、4期合刊，頁85-106。
8. 鄭政誠，1999，〈英國馬克斯史家霍布斯邦「新社會史」之探討〉，《史學集刊》，第31期，頁243-266。
9. 鄭政誠，1999，〈清光緒年間台灣官吏懲處之研究(1875-1895)〉，《台灣人文》，第3號，頁139-166。
10. 鄭政誠，2000，〈日治時期台灣的國策會社——三五公司華南事業經營之研究〉，《台灣人文》，第4號，頁157-184。
11. 鄭政誠，2000，〈評介韓特著《一種特殊關係的形成——1914年前的美國與中國》〉，《輔大歷史學報》，第11期，頁221-232。
12. 鄭政誠，2001，〈跟歷史賽跑〉，《台南師範學院社會科教育學系系刊》，第13期，頁8-12。
13. 鄭政誠，2001，〈虛構或真實？從漫畫《俠王傳》談影視史學與台灣史研究的交集〉，《國立台南師範學院學報》，第34期，頁367-387。
14. 鄭政誠，2002，〈臨時台灣舊慣調查會初創之際的籌劃與運作〉，《台灣文獻》，第53卷第1期，頁135-166。
15. 鄭政誠，2002，〈日本人的調查癖──台灣大調查〉，《少年台灣》，第4期，頁18-65。
16. 鄭政誠，2002，〈變調的造飛機──大戰下的台灣少年工〉，《少年台灣》，第5期，頁68-71。
17. 鄭政誠，2002，〈日治時期臨時台灣舊慣調查會的原住民調查〉，《台灣文獻》，第53卷第4期，頁25-48。
18. 鄭政誠，2003，〈你樂透了嗎？風靡萬眾的五場賭局〉，《少年台灣》，第10期，頁72-75。
19. 鄭政誠，2003，〈探險與調查、學術與立法──日治時期臨時台灣舊慣調查會的原住民調查(1909-1922)〉，《台灣教育史研究會通訊》，第26期，頁2-5。
20. 鄭政誠，2003，〈一個移民與衛星市鎮的社會變遷考察——民國五０至八０年代的三重市〉，《北縣文化》，第79期，頁4-12。
21. 鄭政誠，2003，〈國小社會科教科書內容本土化之形成與省思——以台灣歷史文本為例〉，《台灣教育》，第624期，頁2-8。
22. 鄭政誠，2004，〈三重淹大水 古台北湖再現〉，《自由時報》，頁15。
23. 鄭政誠，2004，〈荷蘭統治下福爾摩莎的故事──四段歷史廣播劇〉，《台灣教育史研究會通訊》，第35期，頁35-40。
24. 鄭政誠，2005，〈舊慣調查1896-1922〉，《重現台灣史》，第20冊，頁7-42。
25. 鄭政誠，2005，〈日治時期台灣總督府內地觀光入理蕃政策〉，《南島史學》(日)，第65、66合併號，頁47-63。
26. 鄭政誠，2005，〈淺談台灣歷史中的經貿與移民〉，《康熙高中歷史教學通訊》，第7期，頁8-13。
27. 鄭政誠，2005，〈我的日本圖書館之旅〉，《台灣教育史研究會通訊》，第41期，頁31-34。
28. 鄭政誠，2006，〈展示與被展示—日治時期臺灣觀光原住民在展覽會中的角色與呈現〉，《兩岸發展史研究》，創刊號，頁67-104。
29. 鄭政誠，2006，〈日治時期臺灣原住民的修學旅行—以蕃童教育所為例〉，《臺灣教育史研究會通訊》，第46期，頁2-14。
30. 鄭政誠，2006，〈日治時期臺灣總督府對福建鐵路的規劃與佈局（1898-1912）〉，《史匯》，第10期，頁1-18。
31. 鄭政誠，2007，〈淺談臺灣歷史中的經貿與移民〉，《康熙高中歷史教學通訊》，第7期，頁8-13。
32. 鄭政誠，2008，〈日治時期台灣舊慣調查對滿洲舊慣調查的輸出—以調查模式與人員的移植為中心〉，《法制史研究》，第13期，頁209-232。
33. 鄭政誠，2008.10，〈淺談臨時台灣舊慣調查會與舊慣立法〉，《台灣學通訊》，第22期，頁6-7。
34. 鄭政誠，2009.3，〈從殖民地的治理性看日治時期的臺灣史〉，2008~2009跨國學者臺灣文化研究論述系列演講專輯，臺南：國立臺南大學臺灣文化研究所，頁141-170。
35. 鄭政誠，2009，〈從《灌園先生日記》看林獻堂的讀書生活〉，《兩岸發展史研究》，第7期，頁89-116。
36. 鄭政誠，2010.6，〈二戰末期臺南師範學校女子講習科的奮起湖疏散生活〉，《南瀛歷史、社會與文化II》，臺南：臺南縣政府，頁175-200。
37. 鄭政誠，2010.11，〈準軍人的養成—日治時期臺灣中等學校的軍事訓練〉，《日據時期臺灣殖民地史學術研討會論文集》，北京：九州出版社，頁295-309。
38. 鄭政誠，2012.4，〈當代臺灣歷史教育的變遷與展望〉，《臺灣教育》，第674期，頁25-30。
39. 鄭政誠，2012.7，〈觀光與教化—日治後期臺灣原住民赴日觀光的實景與判讀〉，《旅行的視線—近代中國與臺灣的觀光文化》，臺北：國立陽明大學人文與社會科學院，頁305-340。
40. 鄭政誠，2012.9，〈當代臺灣歷史教育的變遷與展望—以臺灣史為分析中心〉，《臺灣教育史研究會通訊》，第77期，頁14-25。
41. 鄭政誠，2012.11，〈帝國的師範規訓—以殖民地時期的臺南師範學校為例〉，《臺灣光復六十五週年暨抗戰史實學術研討會論文集》，北京：九州出版社，頁546-560。
42. 鄭政誠，2014.2，〈戰時體制下臺灣原住民青年與學生的觀光旅行（1937-1945）〉，《史匯》第17期，頁1-20。
43. 鄭政誠，2014.3，〈日治時期臺灣教育會的創立與發展〉，《臺灣省教育會百年發展專刊》，臺北：臺灣省教育會，頁30-50。
44. 鄭政誠，2014，〈戰時體制下臺南師範學校學生的軍事訓練與動員(1937-1945)〉，《國史館館刊》，第41期，頁157-186。(THCI CORE)
45. 鄭政誠，2015.7，〈論清法戰爭中馬祖列島的角色與地位〉，《清代臺灣史研究的新進展—紀念康熙統一臺灣330周年國際學術討論會論文集》，北京：九州出版社，頁332-338。
46. 鄭政誠，2016年3月，〈簡朗山：橫跨三個時代的桃園政商名流〉，《桃園文獻》，創刊號，頁147-153。
47. 鄭政誠，2016年9月，〈日治時期桃園公學校的創建營運與教育活動（1897~1921）〉，《桃園文獻》，第二期，頁83-105。
48. 鄭政誠，2016年12月，〈戰後桃園各地志書對日治時期初等教育的書寫分析〉，《臺灣文獻》，第67卷第4期，頁91-124。
49. 鄭政誠，2019.7，〈戰後桃園縣各鄉鎮市志編纂的特色與侷限〉，《經緯桃園：2018桃園學》，桃園：桃園市政府文化局，頁37-68。
50. 鄭政誠，〈從吳新榮日記看小鎮醫生的讀書生活〉，《臺灣文獻》，第71卷第2期，2020年6月，頁103-140。